- g -

• gaf_paired_interleaved_for_each() : vg::io
• gaf_paired_interleaved_for_each_parallel() : vg::io
• gaf_paired_interleaved_for_each_parallel_after_wait() : vg::io
• gaf_to_alignment() : vg::io
• gaf_unpaired_for_each() : vg::io
• gaf_unpaired_for_each_parallel() : vg::io
• gamma_ln() : vg
• gbwt_node_width() : vg
• gbwt_to_handle() : vg
• gbwt_to_pos() : vg
• gcsa_nodes_to_positions() : vg
• generate_haplotype() : vg
• genotype_svs() : vg
• geometric_sampling_prob_ln() : vg
• get_alignment_emitter() : vg
• get_annotation() : vg
• get_avg_baseq() : vg
• get_best_gbwtgraph_gfa_parsing_parameters() : vg
• get_current_vmem_kb() : vg
• get_depth_from_index() : vg::algorithms
• get_dir() : vg::temp_file , xg::temp_file
• get_end_of() : vg
• get_file_size() : vg
• get_fraction_of_ns() : vg
• get_gbwt() : vg
• get_graph_distance() : vg::algorithms
• get_id() : vg , xg
• get_input_file() : vg
• get_input_file_name() : vg
• get_is_rev() : vg , xg
• get_max_rss_kb() : vg
• get_max_vmem_kb() : vg
• get_metavar() : vg::subcommand
• get_metavar< bool >() : vg::subcommand
• get_metavar< double >() : vg::subcommand
• get_metavar< int >() : vg::subcommand
• get_metavar< int8_t >() : vg::subcommand
• get_metavar< size_t >() : vg::subcommand
• get_metavar< std::string >() : vg::subcommand
• get_next_alignment_from_fastq() : vg
• get_next_alignment_pair_from_fastqs() : vg
• get_next_interleaved_alignment_pair_from_fastq() : vg
• get_next_interleaved_record_pair_from_gaf() : vg::io
• get_next_record_from_gaf() : vg::io
• get_next_record_pair_from_gaf() : vg::io
• get_non_hts_alignment_emitter() : vg::io
• get_num_samples() : vg
• get_offset() : vg , xg
• get_option_id() : vg::subcommand
• get_or_estimate_coverage() : vg
• get_or_make_variant_id() : vg
• get_output_file_name() : vg
• get_path() : vg
• get_path_base_name() : vg
• get_proc_status_value() : vg
• get_read_distance() : vg::algorithms
• get_sequence_dictionary() : vg
• get_sequence_visits() : vg
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• get_stream_length() : vg::io
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• get_thread_count() : vg , xg
• get_traversal_of_snarl() : vg
• get_traversal_order() : vg
• getReachableBridges() : vg
• getReachableBridges2() : vg
• gfa_to_handle_graph() : vg::algorithms
• gfa_to_path_handle_graph() : vg::algorithms
• golden_section_search() : vg
• graph_interval_to_string() : vg
• graph_to_gfa() : vg
• guess_parallel_gbwt_jobs() : vg