vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem Member List

This is the complete list of members for vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem, including all inherited members.

chain_component_end	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
chain_component_start	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
children	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
containing_net_handle	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
distance_end_left	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
distance_end_right	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
distance_start_left	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
distance_start_right	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
end_in	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
fragment_best_left	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
fragment_best_right	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
grandparent_net_handle	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
has_grandparent_handle	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
has_parent_handle	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
is_looping_chain	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
is_reversed_in_parent	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
is_trivial_chain	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
loop_left	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
loop_right	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
node_length	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
parent_net_handle	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
prefix_sum_value	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
read_best_left	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
read_best_right	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
read_cluster_heads	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem
set_chain_values(const SnarlDistanceIndex &distance_index)	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem	inline
set_snarl_values(const SnarlDistanceIndex &distance_index)	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem	inline
SnarlTreeNodeProblem(net_handle_t net, size_t read_count, size_t seed_count, const SnarlDistanceIndex &distance_index)	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem	inline
SnarlTreeNodeProblem(net_handle_t net, size_t read_count, size_t seed_count, bool is_reversed_in_parent, size_t node_length, size_t prefix_sum, size_t component)	vg::SnarlDistanceIndexClusterer::SnarlTreeNodeProblem	inline