This is the complete list of members for haplo::linear_haplo_structure, including all inherited members.

cohort	haplo::linear_haplo_structure	private
get_ref_following(int64_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
get_SNP_ref_position(size_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
get_SNV_allele(int64_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
get_type(int64_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
graph	haplo::linear_haplo_structure	private
index	haplo::linear_haplo_structure	private
invalid enum value	haplo::linear_haplo_structure
is_snv(int64_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
is_solitary_ref(int64_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
linear_haplo_structure(istream &slls_index, double log_mut_penalty, double log_recomb_penalty, const vg::PathPositionHandleGraph &graph, vg::path_handle_t ref_path_handle)	haplo::linear_haplo_structure
nodeType enum name	haplo::linear_haplo_structure
nodeType typedef	haplo::linear_haplo_structure
path_mapping_node_id(const vg::Path &path, size_t i) const	haplo::linear_haplo_structure
path_mapping_offset(const vg::Path &path, size_t i) const	haplo::linear_haplo_structure
path_to_input_haplotype(const vg::Path &path) const	haplo::linear_haplo_structure
penalties	haplo::linear_haplo_structure	private
position_assuming_acyclic(int64_t node_id) const	haplo::linear_haplo_structure
ref_path_handle	haplo::linear_haplo_structure	private
ref_span enum value	haplo::linear_haplo_structure
score(const vg::Path &path) const	haplo::linear_haplo_structure
sn_deletion_between_ref(int64_t left, int64_t right) const	haplo::linear_haplo_structure
snv enum value	haplo::linear_haplo_structure
SNVs(const vg::Path &path) const	haplo::linear_haplo_structure
~linear_haplo_structure()	haplo::linear_haplo_structure