haplo::haplo_DP_column Member List

This is the complete list of members for haplo::haplo_DP_column, including all inherited members.

binary_extend_intervals(accessorType &ga, int_itvl_t indices, int_itvl_t ss_deltas, int_itvl_t state_sizes)	haplo::haplo_DP_column	private
current_sum() const	haplo::haplo_DP_column
entries	haplo::haplo_DP_column	private
extend(accessorType &ga)	haplo::haplo_DP_column
get_scores() const	haplo::haplo_DP_column
get_sizes() const	haplo::haplo_DP_column
haplo_DP_column(accessorType &ga)	haplo::haplo_DP_column
is_empty() const	haplo::haplo_DP_column
length	haplo::haplo_DP_column	private
previous_R(size_t i) const	haplo::haplo_DP_column	private
previous_sizes	haplo::haplo_DP_column	private
previous_sum	haplo::haplo_DP_column	private
previous_values	haplo::haplo_DP_column	private
print(ostream &out) const	haplo::haplo_DP_column
standard_extend(accessorType &ga)	haplo::haplo_DP_column	private
sum	haplo::haplo_DP_column	private
update_inner_values()	haplo::haplo_DP_column	private
update_score_vector(haploMath::RRMemo &memo)	haplo::haplo_DP_column	private
~haplo_DP_column()	haplo::haplo_DP_column