Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

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• HASH_TABLE_MAX_WIDTH : minimizer_main.cpp
• HASH_TABLE_MIN_WIDTH : minimizer_main.cpp
• help_add() : add_main.cpp
• help_align() : align_main.cpp
• help_annotate() : annotate_main.cpp
• help_augment() : augment_main.cpp
• help_autoindex() : autoindex_main.cpp
• help_benchmark() : benchmark_main.cpp
• help_call() : call_main.cpp
• help_chain() : chain_main.cpp
• help_chunk() : chunk_main.cpp
• help_circularize() : circularize_main.cpp
• help_clip() : clip_main.cpp
• help_cluster() : cluster_main.cpp
• help_combine() : combine_main.cpp
• help_concat() : concat_main.cpp
• help_construct() : construct_main.cpp
• help_convert() : convert_main.cpp
• help_deconstruct() : deconstruct_main.cpp
• help_depth() : depth_main.cpp
• help_dotplot() : dotplot_main.cpp
• help_explode() : explode_main.cpp
• help_filter() : filter_main.cpp
• help_find() : find_main.cpp
• help_gamcompare() : gamcompare_main.cpp
• help_gampcompare() : gampcompare_main.cpp
• help_gamsort() : gamsort_main.cpp
• help_gbwt() : gbwt_main.cpp
• help_genotype() : genotype_main.cpp
• help_giraffe() : giraffe_main.cpp
• help_haplotypes() : haplotypes_main.cpp
• help_help() : help_main.cpp
• help_ids() : ids_main.cpp
• help_index() : index_main.cpp
• help_inject() : inject_main.cpp
• help_join() : join_main.cpp
• help_kmers() : kmers_main.cpp
• help_map() : map_main.cpp
• help_mask() : mask_main.cpp
• help_mcmc() : mcmc_main.cpp
• help_minimizer() : minimizer_main.cpp
• help_mod() : mod_main.cpp
• help_mpmap() : mpmap_main.cpp
• help_msga() : msga_main.cpp
• help_pack() : pack_main.cpp
• help_paths() : paths_main.cpp
• help_primers() : primers_main.cpp
• help_prune() : prune_main.cpp
• help_rna() : rna_main.cpp
• help_sift() : sift_main.cpp
• help_sim() : sim_main.cpp
• help_simplify() : simplify_main.cpp
• help_snarl() : snarls_main.cpp
• help_sort() : sort_main.cpp
• help_stats() : stats_main.cpp
• help_surject() : surject_main.cpp
• help_trace() : trace_main.cpp
• help_translate() : translate_main.cpp
• help_validate() : validate_main.cpp
• help_vectorize() : vectorize_main.cpp
• help_version() : version_main.cpp
• help_view() : view_main.cpp
• help_viz() : viz_main.cpp
• help_zipcode() : zipcode_main.cpp
• hex2bin() : bin2ascii.h
• hfile_init() : hfile_internal.hpp